महाराष्ट्र पशू आणि मत्स्य विज्ञान विद्यापीठ हे नागपूरमध्ये आहे. 17 नोव्हेंबर 2000 रोजी हे अधिकृतपणे अधिसूचित करण्यात आले. राज्य अधिनियम क्रमांक 1998 अंतर्गत 03 डिसेंबर 2000 रोजी नागपूर येथे मुख्यालयासह त्याची स्थापना करण्यात आली. राज्यातील 4 कृषी विद्यापीठांच्या अंतर्गत असणारी 5 पशुवैद्यकीय महाविद्यालये, एक पशुवैद्यकीय आणि पशुविज्ञान पदव्युत्तर संस्था आणि एक दुग्ध तंत्रज्ञान महाविद्यालय या विद्यापीठाकडे हस्तांतरित करण्यात आली आहेत. विद्यापीठ बाल्यावस्थेत असले तरी ही महाविद्यालये मात्र बरीच जुनी होती.
प्रकारे डिसेंबर 2000 मध्ये राज्यातील विविध भौगोलिक ठिकाणी 5 पशुवैद्यकीय महाविद्यालये, एक पशुवैद्यकीय आणि प्राणी विज्ञान पदव्युत्तर संस्था आणि एक दुग्ध तंत्रज्ञान महाविद्यालय सुरू करण्यात आले. विद्यापीठाने मत्स्य विद्याशाखा विकसित करण्यात आणि दुग्धशाळा तंत्रज्ञान विद्याशाखेच्या बळकटीकरणात प्रशंसनीय प्रगती केली. नागपूर आणि उदगीर येथे नवीन मत्स्य महाविद्यालय आणि उदगीर येथे एक दुग्ध तंत्रज्ञान महाविद्यालय सुरु करण्यात आले.
या विद्यापीठाअंतर्गत 3 विद्याशाखांमधील 10 महाविद्यालये आहेत. निर्देश संचालक, संशोधन संचालक आणि विस्तार शिक्षण संचालक यांच्या मार्गदर्शनाखाली येथे कार्य चालते. याशिवाय विद्यापीठात विद्यार्थी कल्याण विभाग, विद्यापीठ ग्रंथालय, जैव-माहिती केंद्र आणि प्रशिक्षण केंद्रे आहेत. संशोधन आणि विस्तार करण्याच्या नवीन संकल्पनांसह विद्यापीठाने विविध संस्थांसोबत संशोधन प्रकल्प सुरू करण्याची आणि समन्वय साधण्याची योजना आखली आहे.
प्रत्येक महाविद्यालयात विकसित केलेले विभाग आहेत. मुंबईतील भारतातील पहिले पशुवैद्यकीय अणुऔषध केंद्र, अकोला येथील भ्रूण हस्तांतरण तंत्रज्ञान प्रयोगशाळा, नागपूर येथील स्वाइन फीव्हर सर्व्हिलन्स सेंटर इत्यादींचा यात समावेश आहे. पगारावरील खर्च आणि योजनांचा खर्च पूर्ण करण्यासाठी राज्य सरकारच्या वार्षिक अनुदानातून आर्थिक सहाय्य दिले जाते. याव्यतिरिक्त,विद्यापीठाला भारतीय कृषी संशोधन परिषदेकडून राज्य कृषी विद्यापीठ म्हणून विकास अनुदान म्हणून मोठे आर्थिक सहाय्य देखील मिळते. विद्यापीठाच्या संशोधन प्रकल्पांना औषध कंपन्यांचाही पाठिंबा आहे.